تدور القصة في العصر الحديث حيث أصبح امتلاك قوى خاصة شائعًا بين الناس حول العالم، صبي يٌدعى ايزوكو ميدوريا لا يمتلك تلك القوى لكن ما زال يحلم بأن يصبح بطلًا.

سنوات مضت عندما كان الثعلب الشيطان المسمى كيوبي لا يزال موجود، يمتلك هذا الثعلب في المجموع تسعة ذيول قوتها حقا هائلة، فقط واحد من بين التسعة يستطيع هد الجبال وإثارة أمواج عالية. باختصار هذا وحش مخيف وهزيمته شبه مستحيلة إن لم نقل أنها مستحيلة لما هاجم قرية الورقة تصدى له أعتى وأشد الشينوبي بقوة لكن بدون فائدة ، كيوبي لا يهزم بقي الأمر على هذه الحال إلى أن ظهر رجل على أرض المعركة، يمتلك هذا الأخير جرأة وشجاعة لا مثيل لها لقد كان هو الهوكاجي الرابع ونظرا لقوة هذا الوحش لم يبق أمام الهوكاجي الرابع خيار سوى أن يضحي بنفسه لحبس الكيوبي في جسد مولود اسمه ناروتو مرت سنوات عديدة على هذه الحادثة … كبر قليلا ناروتو وبدأ يتعرف على العديد من الشخصيات التي لها دور كبير في حياته و هكذا يعيش العديد من المغامرات المشوقة والكثير من المواقف الكوميدية و المثيرة و المؤثرة ليحقق حلمه بأن يصبح في يوم من الأيام هوكاجي .

تكملة لأحداث الموسم الأوّل Owari No seraph ... تدور احداث القصة حول فايروسات غامضة تقوم بقتل جميع البشر بإستثناء الأطفال أو من هم تحت سن الثالثة عشر (13) في حين  ظهر مصاصي الدماء من ظلام هذا العالم، و قاموا بإختطاف وإستعباد أولئك الأطفال حيث تتم معاملتهم كالماشية