تدور حول حرب الكأس المقدسة السادسة والطاولة المستديرة المقدسة بوحدة مملكة كاميلوت.

سيقتبس قصة بابيلونيا من اللعبة.

قصة الفيبلم تاتي استكمالا لقصة الفيلم الاول Fate/stay night Movie: Heaven's Feel - I. Presage Flower.

في منتصف حرب الكأس المقدسة الخامسة قامت "كاستر" بوضع خطتها قيد التنفيذ حيث بدأت مكيدتها بأسر الخادم الخاص بـ"إيميا شيرو" والمسمى بـ"سيبر" ومع تنامي قوة الساحرة "كاستر" أدرك كلا من "آرشر" و"رين" مدى خطورتها, ومع تغير موازين القوى في الحرب وجد كلا الطرفين "آرشر" و"رين" أنفسهما يسيران في طرق مختلفة إلى أن إنفصلا لينضم "آرشر" للفريق المنتصر بجانب الساحره "كاستر" وتبقى "رين" وحيدة بدون خادم . في هذه الأثناء على الرغم من خسارته لخادمه بالإضافة إلى إصاباته البالغة يضرب "شيرو" بتحذيرات "رين" عرض الحائط ويقرر الإستمرار في النزال و يشق طريقه لينتهي به المطاف مواجها كاستر وواضعا حلمه بأن يكون بطل للعدالة قيد الإختبار . وسط كل هذه الدماء والفوضى ,تتضح دوافع كل من الأسياد والخدم وأسباب رغبتهم في التضحية بكل شيء في سبيل الحصول على الكأس المقدسة .

قصة أنمي Munou na Nana تبدأ بعد أن تم الهجوم على الأرض من قبل الوحوش التي أصبحت تعرف باسم “عدو البشرية”. من أجل التعامل مع هذا التهديد، تم تشكيل مدارس خاصة تتكون من مراهقين ذوي قدرات استثنائية. هؤلاء الأشخاص الذين أصبحوا معروفين باسم “الموهوبين”، ولديهم قدرات يمكنها تحدي قواعد الواقع. من بين هؤلاء الأشخاص الذين يتمتعون بقدرات خارقة، دخيلة، تم إرسالها إلى إحدى هذه المدارس على الرغم من عدم امتلاكها قدرات خاصة فطرية على الإطلاق. هذه قصة الفتاة التي تحاول هزيمة الأعداء عن طريق استعمال الذكاء والتلاعب فقط.

القصة تدور حول الآلهة التي عقدت اجتماعًا لتقرر ما إذا كانت ستسمح للبشر بالعيش أم لا. فالكيري هي الوحيدة التي قدمت مقترحًا للسماح للآلهة والبشر بقتال بعضهم لتقرير مصير البشر. سيقوم 13 إلهًا بمواجهة 13 بشريًا في معارك فردية لتحديد ما إذا كان البشر سيعيشون أم يموتون.

“هذه المرة سوف اهزمه. تعال إلي مرة أخرى... اقبل! ‘إزدهر، مقامر الأرواح!’” في “كيوتو” الجديدة، المدينة التي يحكمها “الملك”، يتم تحديد قيمة الفرد من خلال قوته في لعبة بطاقات “بيلد ديفايد”. انتشرت الشائعات حول مدينة كيوتو الجديدة وملكها. “إذا هزمت الملك في “بيلد ديفايد”، فسيتم تحقيق أي أمنية لك.” من أجل تحدي الملك، يجب أن يشارك الشخص في معركة “تي سي جي” المعروفة باسم “ري بيلد”، ويجب إكمال الـ“كي”. كل شخص لديه أمنية يرغب في تحقيقها. “كورابي تيروتو”، الفتى الذي تعهد بهزيمة الملك، و “بانكا ساكورا”، الفتاة الغامضة التي ترشده، يلقيان بأنفسهما في معركة “ري بيلد”. ليرتفع الستار وتبدأ معركة “تيروتو” وأصدقائه!