تتناول قصة الفلم هذه المرة مهمة أعادة شخص يدعا “موكاد” وهو يحاول تنفيذ تقنية محرمة ، تعود به إلى الوراء ، وأثناء ذلك.. يتم تحريك هذه القوة الغريبة فتحيط بـ “ناروتو” بضوء وعندما أنقشع الضوء وجد نفسه رجع بالزمن  ،، ومن ثم سيقابل والده ، ومن ثم تبدأ المغامرة الرائعة..