حرب الكأس المقدسة هي معركة محتدمة بين سبع سحرة الذين يعملون كأسياد عن طريق إستخدام أختام الأمر التي يحصلون عليها عندما يدخلون في الحرب , والتي يمكنهم من خلالها إعطاء الأوامر للأرواح البطوليه التي يستدعونها للعمل كخدم للقتال في الحرب . في هذه الحرب الفتاة "رين توساكا" بين السحره المتنافسين و التي تأمل الحصول على الجائزه الكبرى في الحرب ألا وهي الكأس المقدسة , والكأس المقدسة هي بمثابة قطعة أثرية سحرية قادرة على منح مالكها أي أمنية يتمناها . أحد زملاء الفصل لـ"رين" الفتى "إيميا شيرو" عن طريق الصدفه يجد نفسه متورطا بحرب الكأس المقدسه كأحد السحره السبعه وينتهي به الأمر مستدعيا أحد الخدم المعروف بإسم "سيبر" , وبمواجهة العديد من الأعداء الأقوياء المتحدين يقرر رين وشيرو التحالف مؤقتا لمواجهة خصومهم في الحرب .

في منتصف حرب الكأس المقدسة الخامسة قامت "كاستر" بوضع خطتها قيد التنفيذ حيث بدأت مكيدتها بأسر الخادم الخاص بـ"إيميا شيرو" والمسمى بـ"سيبر" ومع تنامي قوة الساحرة "كاستر" أدرك كلا من "آرشر" و"رين" مدى خطورتها, ومع تغير موازين القوى في الحرب وجد كلا الطرفين "آرشر" و"رين" أنفسهما يسيران في طرق مختلفة إلى أن إنفصلا لينضم "آرشر" للفريق المنتصر بجانب الساحره "كاستر" وتبقى "رين" وحيدة بدون خادم . في هذه الأثناء على الرغم من خسارته لخادمه بالإضافة إلى إصاباته البالغة يضرب "شيرو" بتحذيرات "رين" عرض الحائط ويقرر الإستمرار في النزال و يشق طريقه لينتهي به المطاف مواجها كاستر وواضعا حلمه بأن يكون بطل للعدالة قيد الإختبار . وسط كل هذه الدماء والفوضى ,تتضح دوافع كل من الأسياد والخدم وأسباب رغبتهم في التضحية بكل شيء في سبيل الحصول على الكأس المقدسة .

تتحدث القصة عن حرب الكأس المقدسة، التي تجري أحداثها كل10 سنوات، ويقال أن هذه الكأس آداة قادرة على فعل المعجزات وتحقيق الأمنيات. وها هي تعود حرب الكأس المقدسة الرابعة بعد أن أوجلت خاتمتها لثلاث مرات… فيستدعى في هذه الحرب سبعة من السحرة يعرفون بالسادة كل منهم يقوم بآداء طقوس خاصة لإستدعاء أحد الأرواح البطولية ويعرفون بالخدم (هم أرواح الأبطال القدماء). وكل خادم يمتلك قواه الخاصة وأسلحته التي تعرف بالأوهام النبيلة… فيجتمع السحرة مع خدمهم في ساحة القتال المختارة وهي مدينة فويوكي ليبدأ بينهم القتال من أجل الفوز بالكأس المقدسة.

تكملة لأحداث الموسم الأول واللذي يتحدث عن حرب الكأس المقدسة، التي تجري أحداثها كل 10 سنوات، ويقال أن هذه الكأس آداة قادرة على فعل المعجزات وتحقيق الأمنيات. وها هي تعود حرب الكأس المقدسة الرابعة بعد أن أوجلت خاتمتها لثلاث مرات… فيستدعى في هذه الحرب سبعة من السحرة يعرفون بالسادة كل منهم يقوم بآداء طقوس خاصة لإستدعاء أحد الأرواح البطولية ويعرفون بالخدم (هم أرواح الأبطال القدماء). وكل خادم يمتلك قواه الخاصة وأسلحته التي تعرف بالأوهام النبيلة… فيجتمع السحرة مع خدمهم في ساحة القتال المختارة وهي مدينة فويوكي ليبدأ بينهم القتال من أجل الفوز بالكأس المقدسة. 

في مدينة أوراريو ، أسفل برج طويل القامة ، توجد الزنزانة. فقط المغامرين الذين يشكلون شراكات مع الآلهة لديهم أي أمل في هزيمة الوحوش التي تكمن في الداخل. لكن الزنزانة ليست المكان الوحيد الذي توجد فيه الوحوش. بعيدا عن Orario ، في أنقاض مدينة قديمة ، ينشأ تهديد جديد. لمواجهة هذا التهديد ، جاءت إلهة أرتميس إلى أوراريو بحثًا عن بطل - لكنها ليست أيس والينشتاين (أميرة السيف الأسطورية) ولا أوتار (المحارب الأقوى الذي دخل إلى الزنزانة) التي اختارتها. بدلا من ذلك هو بيل كرانيل ، مغامر مبتدئ في شراكة مع إلهة منخفضة المستوى.

القصة تدور حول مبرمج عمره 29 عامًا يجد نفسه بداخل عالم لعبة "أر بي جي" وأصبح يدعى ساتو و يبلغ من العمر 15 عامًا، في البداية ظن بانه يحلم لكن خبرته تبدو حقيقية، و نظرًا لقدرته القوية استطاع هزيمة جيش كامل من رجال السحالي و أصبح مستواه عاليًا جدًا، بعدها قرر بطلنا إخفاء مستواه و العيش بسلام و كذلك التعرف على أصدقاء جدد في اللعبة، لكن تطور قصة اللعبة تسير عكس ما يشتيه خصوصًا مع عودة ملك الشياطين