مملكه أرانداس المتحدة والاتحاد الوطني لـ إينجيلميا في حالة حرب مستمرة لسنوات طويله، والوضع قد وصل الي نهاية مسدودة بالقرب من الجدار العظيم، الذي لم يُخترق قط منذ تأسيس أرانداس، ظلت البوابه المؤديه الى الحصن مغلقة باحكام، ولكن عندما تُفتح، مجرى الحرب يبدأ بالتغير بشكل كبير
في المستقبل البعيد في أقاصي المجرة، في زمن تحالف فيه البشر ليستطيعوا البقاء أمام عرق جديد بشع من الكائنات يسمى ” Hidiaasu “، وخلال إحدى المعارك يدخل بطل هذا العمل الملازم Redo ومعه الآلي الخاص فيه في فجوة زمنية، وعندما يستيقظ يجد نفسه في على كوكب الأرض، والكوكب مغمور بمياه البحار، والبشر يعيشون على أساطيل من السفن العملاقة، ينتشلون الأثار المتبقية من قاع البحر من أجل البقاء على قيد الحياة. Redo يجد نفسه على أحدى هذه السفن وتدعى ” Gargantia ” ويجبر على العيش بجوار فتاة تبلغ من العمر 15 سنة وتدعى Amy التي تعمل ساعية على متن هذه السفينة. Redo ليس لديه المعرفة بتاريخ هذا الكوكب وثقافة سكانه، فبالنسبة له لا يعرف شيئا غير القتال من حيث أتى، فيتفاجئ بالسلام المنتشر هنا فما الذي سيحدث بعد ذلك …
تكملة لأحداث الموسم السابق حيث تتحدث القصة عن البشر بعد فرارهم من كوكب الأرض بسبب هجوم مخلوقات غريبة تسمى غاونا , بعد مغادرتهم الى الفضاء عبر سفن ضخمة يقوم الغاونا بملاحقتهم , يتطور البشر و يقومون بعدها بمهاجمة الغاونا عن طريق آليات تسمى موريتو , بطل القصة شاب يدعى ناجاتي تانيكازي و طيار يقود احدى آليات الموريتو على متن سفينة تدعى سيدونيا و يدافع عن ركابها من هجمات الغاونا
القصةُ تتحدث عن البشر بعد فرارهم من كوكب الأرض بسبب هجوم مخلوقات غريبة تسمى غاونا , بعد مغادرتهم الى الفضاء عبر سفن ضخمة يقوم الغاونا بملاحقتهم , يتطور البشر و يقومون بعدها بمهاجمة الغاونا عن طريق آليات تسمى موريتو , بطل القصة شاب يدعى ناجاتي تانيكازي و طيار يقود احدى آليات الموريتو على متن سفينة تدعى سيدونيا و يدافع عن ركابها من هجمات الغاونا
اخترع البروفيسور جيزو كابوتو مازنجر زد بعد أن اكتشف خطة دكتور هيل للسيطره على العالم، لكن رجال دكتور هيل قتلوا البروفيسور بعد أن أكمل صنع مازنجر زد بعد أن عاد كوجي وأخوه الصغير شيرووجدوا جدهم البروفيسور على حافة الموت فطلب البروفيسور من كوجي أن يرى ما في القبو،وبعد تلك الكلمات الأخيره توفى البرفيسور فذهب كوجي لينفذ ما أمره جده فوجد هناك مازنجر زد بإنتظاره
